とある出会いから死神の力を手にし《死神代行》となった黒崎一護は、 現世で死した魂魄が集う場所・尸魂界（ソウル・ソサエティ）の動乱に巻き込まれ、 熾烈な戦いの中、 仲間と共に大きく成長を遂げてきた。そんな一護の暮らす空座町（からくらちょう）で異変が起こる。 新たなる死神と、 新たなる敵の出現。 そして救いを求める声。 一護は再び斬魄刀を取り、 戦場へと旅立つ。一方、 尸魂界では、 現世における突然の虚（ホロウ）の連続消失が観測され、 この地へ導かれた魂が暮らす流魂街での住民達の失踪が発生、 さらには死神たちの住む霊屋・瀞霊廷が賊軍に襲撃される。賊軍の正体は、 滅却師（クインシー）の始祖・ユーハバッハが率いる《見えざる帝国（ヴァンデンライヒ）》。《見えざる帝国》は、 死神たちに宣戦布告する。5日後、 尸魂界は“見えざる帝国”により殲滅される。千年の長きにわたり死神たちが背負っていた因縁。 その宿業と秘められた真実がついに紐解かれる。全ては終焉へ。 黒崎一護の、 最後の戦いが始まる――。